有限责任公司未能设立时，入资款的处理方式，对于已经出资的股东，公司需要返还出资；对于未能出资的股东，不需要再出资。并且公司的设立人需要依法承担为设立公司而支出的相关费用和损失赔偿责任。
【法律依据】
《中华人民共和国公司法》第二十六条
有限责任公司的注册资本为在公司登记机关登记的全体股东认缴的出资额。
法律、行规以及决定对有限责任公司注册资本实缴、注册资本最低限额另有规定的，从其规定。
第二十七条
股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行规规定不得作为出资的财产除外。
对作为出资的非货币财产应当评估作价，核实财产，不得高估或者低估作价。法律、行规对评估作价有规定的，从其规定。
